پرداخت از طریق درگاههای اینترنتی معمولترین روش پرداخت در فروشگاه آنلاین است. پرداخت با این روش با وارد کردن شماره شانزده رقمی روی کارت، رمز دوم یا رمز خرید اینترتی، cvv2 و تاریخ انقضای کارت در محل های مشخص شده در درگاه اینترنتی انجام میشود.
یکی دیگر از انواع روش های پرداخت در فروشگاه آنلاین، پرداخت در محل است. پرداخت در محل به دو روش پرداخت نقدی، پرداخت با استفاده از دستگاههای کارتخوان (که توسط تحویل دهنده کالا ارائه میگردد) انجام میشود.
پرداخت کارت به کارت یکی دیگر از انواع روشهای پرداخت در فروشگاه آنلاین است.